為了讓保健食品的生產經營行為得到全方面的規(guī)范，加強企業(yè)索證票和臺賬管理，國家食品藥品監(jiān)管局組織制定了《保健食品生產經營企業(yè)索證索票和臺賬管理規(guī)定》（以下稱《規(guī)定》），《規(guī)定》自2013年3月1日起正式實施。
    《規(guī)定》要求，保健食品生產經營企業(yè)應當建立索證索票和進貨查驗記錄制度，設立相關部門或指定專人負責索取并查驗供貨者資質及相關產品質量安全的有效證明文件，留存相關票證文件建檔備查，同時加強臺賬管理，如實記錄購銷信息。有關文件應當保存至產品保質期結束后1年，且保存期限不得少于2年。要求生產經營企業(yè)應逐步實現信息化管理，建立電子檔案。
    《規(guī)定》明確了生產經營企業(yè)索證索票應當包括的內容。針對實行統(tǒng)一購進、統(tǒng)一配送、統(tǒng)一管理的連鎖經營企業(yè)，《規(guī)定》明確，可由總部統(tǒng)一索取查驗相關證、票并存檔，建立電子化檔案，供各連鎖經營企業(yè)從經營終端進行查詢索證情況。各連鎖經營企業(yè)自行采購的保健食品，應當按照要求自行索證索票。
    《規(guī)定》要求保健食品生產經營企業(yè)要對購貨、銷售臺賬做如實記錄，并對質量不合格的原料、輔料、包裝材料或保健食品的召回、退貨、銷毀等處理情況也做如實記錄。